Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERPINA1P01009 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms