Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms