Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms