Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ERVK13-1Q9NX77 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK13-1Q9NX77 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms