Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SDHAF3Q9NRP4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms