Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PTPRHQ9HD43 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRHQ9HD43 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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