Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAF1Q9H7N4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms