Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms