Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGAP3Q96FM1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms