Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC84Q86UT8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms