Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms