Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms