Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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