Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TWIST1Q15672 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms