Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 CARF-216ENST00000444724 2854 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.052e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CAPZA2-211ENST00000484325 324 ntTSL 1 (best)8.45□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PPARGC1A-218ENST00000617484 1026 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.072e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 UBE2H-209ENST00000496698 561 ntTSL 48.3□□□□□ -1.082e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 DERA-207ENST00000531803 735 ntTSL 58.28□□□□□ -1.082e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.111e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 AC022400.3-201ENST00000399449 3810 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ITFG2-AS1-202ENST00000636122 962 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.142e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 UBE2H-206ENST00000483368 619 ntTSL 1 (best)7.84□□□□□ -1.152e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MECP2-208ENST00000481807 436 ntTSL 37.82□□□□□ -1.162e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 RPRD1B-208ENST00000618318 567 ntTSL 47.75□□□□□ -1.172e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 DERA-206ENST00000530274 712 ntTSL 27.74□□□□□ -1.172e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SCLY-214ENST00000463433 916 ntTSL 57.74□□□□□ -1.172e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PTPN14-205ENST00000543945 3842 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.22e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-208ENST00000502304 469 ntTSL 57.55□□□□□ -1.22e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PPARGC1A-204ENST00000506055 2627 ntTSL 1 (best)7.49□□□□□ -1.212e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.242e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-217ENST00000508826 329 ntTSL 57.29□□□□□ -1.242e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.252e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.272e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.352e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 RPRD1B-207ENST00000614670 659 ntTSL 36.24□□□□□ -1.412e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PPARGC1A-209ENST00000509702 2704 ntTSL 56.18□□□□□ -1.422e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.452e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CARF-220ENST00000471271 929 ntTSL 25.97□□□□□ -1.452e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.462e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-218ENST00000509195 350 ntTSL 55.9□□□□□ -1.462e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CARF-206ENST00000422368 1592 ntTSL 1 (best)5.87□□□□□ -1.472e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 DERA-205ENST00000528821 1113 ntTSL 25.84□□□□□ -1.472e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 DERA-202ENST00000524480 814 ntTSL 55.59□□□□□ -1.512e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-221ENST00000510524 418 ntTSL 55.57□□□□□ -1.522e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.542e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.542e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CAPZA2-204ENST00000426421 1214 ntTSL 55.29□□□□□ -1.562e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ATRX-219ENST00000625063 593 ntTSL 55.25□□□□□ -1.572e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.572e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.592e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CAPZA2-210ENST00000466023 626 ntTSL 35.08□□□□□ -1.62e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-209ENST00000502456 445 ntTSL 54.93□□□□□ -1.622e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-231ENST00000514275 296 ntTSL 54.93□□□□□ -1.622e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CAPZA2-203ENST00000417431 517 ntTSL 34.88□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CAPZA2-208ENST00000464669 898 ntTSL 24.82□□□□□ -1.642e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CAPZA2-205ENST00000449080 814 ntTSL 54.56□□□□□ -1.682e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CAPZA2-207ENST00000464223 164 ntTSL 1 (best)4.5□□□□□ -1.692e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.692e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PPARGC1A-208ENST00000509642 1391 ntTSL 24.47□□□□□ -1.692e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PPARGC1A-207ENST00000508380 576 ntTSL 44.44□□□□□ -1.72e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PPARGC1A-210ENST00000512169 550 ntTSL 44.37□□□□□ -1.712e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.722e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.732e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.766e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.762e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SON-220ENST00000492229 306 ntTSL 52.08□□□□□ -2.082e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.332e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TBL1XR1-216ENST00000491623 582 ntTSL 54.85□□□□□ -1.636e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.014e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MAPKAPK5-201ENST00000546394 567 ntTSL 317.15■□□□□ 0.345e-10■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MAPKAPK5-209ENST00000553053 875 ntTSL 517.08■□□□□ 0.325e-10■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.085e-10■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ARHGAP12-206ENST00000454919 586 ntTSL 36.38□□□□□ -1.396e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ARHGAP12-210ENST00000497103 732 ntTSL 36.15□□□□□ -1.426e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MAPKAPK5-205ENST00000549875 974 ntTSL 55.05□□□□□ -1.65e-10■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TGIF2-203ENST00000557885 659 ntTSL 212.6□□□□□ -0.399e-21■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TGIF2-207ENST00000561398 797 ntTSL 311.3□□□□□ -0.69e-21■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TGIF2-205ENST00000558465 785 ntTSL 39.18□□□□□ -0.949e-21■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.511e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.471e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TFCP2-203ENST00000548108 1508 ntTSL 1 (best)12.38□□□□□ -0.431e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.278e-9■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ARHGEF11-207ENST00000492592 864 ntTSL 316.11■□□□□ 0.173e-8■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.593e-8■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ISYNA1-204ENST00000577916 2148 ntTSL 524.14■■□□□ 1.459e-8■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 221.3■■□□□ 19e-8■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.779e-8■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.339e-8■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ISYNA1-210ENST00000582770 1654 ntTSL 217.05■□□□□ 0.329e-8■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ISYNA1-203ENST00000577820 1466 ntTSL 513.78□□□□□ -0.29e-8■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 RBM17-203ENST00000432931 805 ntTSL 320.03■□□□□ 0.86e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 RBM17-204ENST00000437845 833 ntTSL 317.42■□□□□ 0.386e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.376e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.016e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.166e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 RBM17-205ENST00000446108 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.926e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 COL4A5-205ENST00000483338 3622 ntTSL 1 (best)7.2□□□□□ -1.266e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 UBALD1-204ENST00000588691 281 ntTSL 322.9■■□□□ 1.261e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.011e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.931e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.881e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.55■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 NMT2-202ENST00000378165 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.444e-11■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 NMT2-201ENST00000378150 2457 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.844e-11■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 NMT2-204ENST00000478580 840 ntTSL 36.29□□□□□ -1.44e-11■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CYC1-204ENST00000533444 1832 ntTSL 1 (best)26.4■■□□□ 1.822e-6■■■■□ 23.1
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