Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
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