Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME4Q14997 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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