Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM25Q14258 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms