Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK13Q14004 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
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