Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms