Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1SQ13698 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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