Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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