Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 DCAF1-201ENST00000335891 4114 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.723e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 POLDIP3-204ENST00000445215 3337 ntTSL 1 (best)10.48□□□□□ -0.732e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 DCAF1-203ENST00000504652 5951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.773e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 DCAF1-202ENST00000423656 5946 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.783e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 DLEU1-212ENST00000469754 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.832e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 LINC00467-201ENST00000423222 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.922e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.121e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 LINC00467-204ENST00000610948 469 ntTSL 27.36□□□□□ -1.232e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.312e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 MRPS18C-207ENST00000509970 855 ntTSL 36.49□□□□□ -1.371e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC5.59□□□□□ -1.512e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.26□□□□□ -1.732e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 SF3A3-206ENST00000487062 775 ntTSL 27.91□□□□□ -1.142e-29■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 EIF3L-201ENST00000381683 1599 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.326e-11■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 SNF8-203ENST00000504000 1899 ntTSL 216.3■□□□□ 0.24e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 SNF8-215ENST00000515572 687 ntTSL 214.05□□□□□ -0.164e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 PRMT7-224ENST00000568463 1848 ntTSL 216.02■□□□□ 0.162e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.142e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.032e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 PRMT7-223ENST00000567542 3542 ntTSL 1 (best)14.22□□□□□ -0.132e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 PRMT7-225ENST00000568975 2996 ntTSL 212.68□□□□□ -0.382e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.051e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.755e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 FLOT2-204ENST00000577789 2503 ntTSL 518.2■□□□□ 0.55e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 FLOT2-206ENST00000580805 2679 ntTSL 518.15■□□□□ 0.55e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 FLOT2-209ENST00000584569 266 ntTSL 317.55■□□□□ 0.45e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.365e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.145e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 NDUFA11-204ENST00000591341 403 ntTSL 219.58■□□□□ 0.726e-9■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.61e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.126e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.116e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 UBE2V1-207ENST00000420027 1956 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.16e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 UBE2V1-203ENST00000371674 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.226e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 UBE2V1-206ENST00000415862 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.516e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.896e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 UBE2V1-205ENST00000396059 1983 ntTSL 1 (best)9.41□□□□□ -0.96e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.956e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.016e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.156e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 PRELID1-207ENST00000510797 712 ntTSL 328.91■■■□□ 2.225e-9■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 PRELID1-208ENST00000511309 778 ntTSL 226.33■■□□□ 1.815e-9■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 EXOSC1-210ENST00000485122 564 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.361e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 ISYNA1-209ENST00000582287 696 ntTSL 1 (best)23.04■■□□□ 1.281e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 SND1-214ENST00000489417 1447 ntTSL 223.81■■□□□ 1.43e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.523e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.944e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.151e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 SF3B1-209ENST00000479532 587 ntTSL 27.21□□□□□ -1.261e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.277e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 EIF3L-209ENST00000460638 348 ntTSL 23.59□□□□□ -1.835e-12■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.051e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.091e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.429e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 RPS23-202ENST00000503605 595 ntTSL 321■□□□□ 0.951e-49■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.467e-28■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.617e-28■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 PPIA-205ENST00000479021 552 ntTSL 411.98□□□□□ -0.493e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 PPIA-204ENST00000468812 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.923e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.239e-9■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.89e-9■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 RAD23A-210ENST00000593114 1691 ntTSL 519.13■□□□□ 0.659e-9■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 RAD23A-206ENST00000590881 999 ntTSL 516.16■□□□□ 0.189e-9■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.149e-9■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 H3F3B-210ENST00000591890 783 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.331e-45■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.22e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TMEM161A-209ENST00000587985 1754 ntTSL 520.49■□□□□ 0.872e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TMEM161A-205ENST00000587406 1923 ntTSL 519.22■□□□□ 0.672e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.642e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TMEM161A-210ENST00000589448 1799 ntTSL 519.05■□□□□ 0.642e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.582e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.032e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HPS1-201ENST00000325103 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.082e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HPS1-204ENST00000361490 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HPS1-208ENST00000467246 2791 ntTSL 1 (best)12.69□□□□□ -0.382e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.225e-9■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.955e-9■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 PLEKHJ1-210ENST00000588633 379 ntTSL 519.94■□□□□ 0.784e-10■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 MIIP-205ENST00000478749 779 ntTSL 218.15■□□□□ 0.52e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TIMM50-215ENST00000601252 1737 ntTSL 515.68■□□□□ 0.19e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 ETFA-204ENST00000557975 1086 ntTSL 36.61□□□□□ -1.351e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 56.34□□□□□ -1.391e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.63e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.223e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.143e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.753e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.523e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.43e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HMBS-224ENST00000546226 2112 ntTSL 216.57■□□□□ 0.243e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.063e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HMBS-217ENST00000543543 1796 ntTSL 512.33□□□□□ -0.443e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HMBS-210ENST00000539045 845 ntTSL 212.33□□□□□ -0.443e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 YWHAB-207ENST00000631616 5867 ntTSL 1 (best)18.6■□□□□ 0.571e-11■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.018e-35■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 ATXN2L-219ENST00000566007 471 ntTSL 311.13□□□□□ -0.638e-35■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.818e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 MRPS24-202ENST00000414932 1727 ntTSL 225.64■■□□□ 1.77e-10■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 PLK1-205ENST00000564794 683 ntTSL 520.91■□□□□ 0.943e-6■■□□□ 14.4
PABPC4Q13310 BAG1-209ENST00000493917 526 ntTSL 56.26□□□□□ -1.412e-8■■□□□ 14.4
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