Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLN3Q13286 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN3Q13286 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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