Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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