Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms