Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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