Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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