Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TROQ12816 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TROQ12816 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROQ12816 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROQ12816 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TROQ12816 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROQ12816 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TROQ12816 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROQ12816 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROQ12816 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROQ12816 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROQ12816 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TROQ12816 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TROQ12816 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TROQ12816 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TROQ12816 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TROQ12816 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TROQ12816 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TROQ12816 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TROQ12816 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TROQ12816 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TROQ12816 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TROQ12816 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
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