Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TWF1Q12792 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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