Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4DQ08499 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms