Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms