Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUCB1Q02818 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUCB1Q02818 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUCB1Q02818 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms