Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL18AQ02543 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms