Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG4Q00888 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms