Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms