Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms