Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DAP3P51398 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DAP3P51398 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms