Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LHX1P48742 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LHX1P48742 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LHX1P48742 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LHX1P48742 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms