Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CBP42338 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms