Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms