Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP6V1E1P36543 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms