Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHI3L1P36222 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms