Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms