Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCAP28676 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GCAP28676 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GCAP28676 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms