Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTX3P26022 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTX3P26022 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms