Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO1P25800 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO1P25800 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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