Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EPCAMP16422 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms