Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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TMEM225BP0DP42 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TMEM225BP0DP42 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TMEM225BP0DP42 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TMEM225BP0DP42 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TMEM225BP0DP42 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM225BP0DP42 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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