Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4AP0C0L4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms